FMIPA Universitas Jember sebagai institusi pendidikan mendukung diadakannya pertemuan ilmiah yang dalam penyelenggaraanya dalam bentuk seminar nasional maupun seminar internasional. Dengan penyelenggara dari FMIPA sendiri ataupun Program Studi di Fakultas MIPA Universitas Jember. Beberapa seminar dijadikan agenda tahunan maupun secara berkala oleh FMIPA UNEJ adalah sebagai berikut:

1. International Basic Science Conference (IBSC)
2. International Conference on Life Science and Biotechnology (ICOLIB)

3. Seminar Nasional Matematika (SNM)
4. Seminar Nasional Fisika (SENAFIS)
5. Seminar Nasional Kimia (SNK)