FMIPA Universitas Jember sebagai institusi pendidikan mendukung diadakannya pertemuan ilmiah yang dalam penyelenggaraanya dalam bentuk seminar nasional maupun seminar internasional. Dengan penyelenggara dari FMIPA senditi ataupun Program Studi – Program Studi di FMIPA Universitas Jember. Beberapa seminar dijadikan agenda tahunan maupun secara berkala oleh FMIPA UNEJ adalah sebagai berikut:

1. International Basic Science Conference (IBSC)
2. International Conference on Life Science and Biotechnology (ICOLIB)
3. Seminar Nasional Matematika (SNM)
4. Seminar Nasional Fisika (SENAFIS)
5. Seminar Nasional Kimia (SNK)